tRNA salah satu yang mentransfer molekul asam amino ke ribosom, untuk kemudian diurutkan menjadi di sepanjang molekul messenger RNA (mRNA); Asam amino ini bergabung dengan ikatan peptida untuk membentuk protein selama proses sintesis protein.
Setiap jenis tRNA secara khusus bergabung dengan 1 dari 20 asam amino untuk dimasukkan ke dalam protein.3 Ada lebih dari satu molekul tRNA untuk setiap asam amino. Antikodon adalah urutan dari tiga basa atau triplet yang tidak berpasangan yang akan menentukan asam amino yang dapat diikat tRNA. Beberapa antikodon dapat bergabung dengan asam amino yang sama, untuk alasan inilah kode tersebut dikatakan mengalami degenerasi. Antikodon serupa, biasanya basa ketiga yang dapat berubah, mereka akan berikatan dengan kodon, triplet basa RNA pembawa pesan.
tRNA (transfer RNA) adalah jenis RNA yang bertindak sebagai “elemen perantara” yang memainkan peran penting dalam memuat dan mentransfer asam amino ke situs sintesis protein, yaitu Ribosom. tRNA pertama menerjemahkan informasi atau urutan nukleotida yang dibawa oleh m-RNA. Oleh karena itu, tRNA juga memainkan peran utama dalam proses “sintesis protein”, atau kita dapat mengatakan “Terjemahan mRNA menjadi protein”.
Untuk mendapatkan ide ini, mari kita anggap m-RNA membawa kode atau urutan nukleotida dari DNA dan tRNA adalah kunci untuk kode yang membawa antikodon yang menerjemahkan kode kod m-RNA. Pasangan komplementer terjadi antara kodon triplet m-RNA dengan antikodon tRNA.
Kodon m-RNA membawa informasi genetik yang menentukan jenis asam amino yang akan mengikat ke situs akseptor asam amino tRNA. RNA transfer dinamai untuk peran kuncinya dalam mentransfer asam amino ke ribosom dengan membaca informasi yang diberikan oleh m-RNA.
Pengertian
tRNA adalah jenis RNA yang bertindak sebagai molekul pembawa yang memuat asam amino dengan mendekode informasi genetik yang dibawa oleh kodon m-RNA dan mengubahnya menjadi protein fisik.
tRNA adalah untai tunggal yang memiliki ujung 5′-3 ‘di mana’ t ‘adalah singkatan dari “Transfer” karena mentransfer asam amino yang diaktifkan ke situs ribosom atau tempat sintesis protein.
Ciri-ciri:
- Transfer RNA disebut sebagai “RNA terlarut” karena dapat larut dalam larutan konsentrasi 1M NaCl.
- tRNA juga disebut sebagai “Adaptor RNA” karena membawa asam amino ke ribosom.
- Transfer RNA memberikan kontribusi sekitar 10-15% dari RNA seluler.
- T-RNA adalah struktur yang sangat terlipat karena nukleotida mendekat satu sama lain dan tampak seperti untaian ganda.
- Konstanta sedimentasi tRNA adalah 3,8 S dan berat molekul Dalton adalah 25.000–30.000.
- tRNA adalah bentuk terkecil RNA yang terdiri dari 75-95 basa nukleotida.
- Ada dua puluh jenis tRNA, karena ada 20 jenis asam amino.
- Transfer RNA berbeda dari molekul RNA lainnya karena terdiri dari basa abnormal dan termodifikasi seperti pseudouracil, inosine, dihydrouridine dll.
- Dalam struktur tRNA, ada tiga struktur melingkar yang terbentuk karena pasangan basa abnormal di mana tidak ada ikatan hidrogen. Batang tRNA terdiri dari pasangan basa biasa yang saling mengikat melalui ikatan hidrogen dan tidak ada pembentukan lingkaran seperti itu.
- Lengan DHU dari tRNA terdiri dari di-hidroksi uridin sebagai basa abnormal.
- Lengan antikodon t-RNA terdiri dari Inosin sebagai basa abnormal
- Lengan TΨC terdiri dari pseudouracil sebagai nukleotida yang tidak biasa.
Struktur
Ada tiga konfigurasi struktural transfer RNA yaitu struktur primer, sekunder dan tersier.
Struktur primer tRNA.
Dalam struktur primer, tRNA memiliki struktur linier dan 60-90 nukleotida. Struktur utama membentuk “Pasca transkripsi”. Pada ujung 3, urutan CCA hadir. T-RNA yang terisi daya merakit asam amino dalam urutan yang benar di mana gugus COOH menempel di atas ujung 3-OH.
Itu memiliki sejumlah besar basa yang dimodifikasi. Ada 15 residu invarian dan 8 residu semi-invarian yang terdapat dalam struktur primer tRNA yang posisinya mengarah pada pembentukan struktur sekunder dan tersier t-RNA.
Struktur sekunder tRNA.
“Clover-Leaf model” adalah model yang paling populer untuk menjelaskan struktur sekunder transfer RNA yang diberikan oleh Robert Holley pada tahun 1968. Menurut model cloverleaf, ada empat lengan tRNA, dan kadang-kadang satu lengan tambahan juga ada.
Akseptor, DHU, Antikodon, dan TΨC adalah empat lengan yang ditemukan dalam struktur RNA transfer dan sebagai tambahan, satu lengan Variabel juga dapat ditemukan.
Lengan akseptor.
Ini juga merujuk sebagai situs untuk “lampiran asam amino” dan terdiri dari 7 nukleotida berpasangan dan 4 basa tidak berpasangan. Lengan akseptor adalah batang heliks ganda yang memiliki ujung 3 ‘dan 5’. 3-end terdiri dari urutan CCA yang mengacu pada “Terminal ACC-sequence”. Kelompok karboksil asam amino melekat dengan ujung 3′-OH. Di ujung 5, guanin selalu ada. Oleh karena itu, dapat didefinisikan sebagai tempat perlekatan asam amino teraktivasi.
Lengan DHU.
Di sini, DHU singkatan dari “Di-hidroksi uridin”. DHU kadang-kadang merujuk sebagai “D-lengan” yang terdiri dari 15-18 basa nukleotida total dari yang 7-12 adalah basa yang dimodifikasi dan 4 dengan basa biasa. Lengan ini terdiri dari batang panjang 4bp dan satu lilitan dengan 7 basa pirimidin yang tidak biasa termasuk dihidroksi uridin.
D-lengan juga dikenal sebagai “situs pengikatan Aminoacyl synthetase” karena mengaktifkan sintesis asam amino dengan mensintesis enzim yang disebut “Aminoacyl tRNA synthetase”. Enzim mempromosikan pengikatan asam amino spesifik dan kuat ke t-RNA dengan bantuan molekul ATP.
Lengan DHU memainkan peran yang sangat penting dalam stabilisasi struktur tersier t-RNA. Ada dua daerah variabel yang hadir di kedua sisi residu guanin disebut sebagai daerah variabel α dan β.
Lengan antikodon.
Itu juga merujuk sebagai “situs pengenalan kodon”. Lengan antikodon juga terdiri dari batang yang panjangnya 5bp dan satu lingkaran terdiri dari 7 basa yang tidak berpasangan. Di antara tujuh basa loop antikodon yang tidak berpasangan, ada tiga antikodon. Antikodon mengenali kodon m-RNA dan saling mengikat padanya.
Antikodon dalam loop menentukan jenis asam amino yang akan menempel pada ujung 3-tRNA. Oleh karena itu, lengan antikodon adalah bagian paling penting dari transfer RNA yang mengenali dan membaca informasi yang dibawa oleh m-RNA.
Lengan TΨC.
Di sini, TΨC adalah singkatan dari “Timin pseudourasil sitosin”. Lengan TΨC juga terdiri dari batang yang panjangnya 5bp dan satu lingkaran dengan 7 basa yang tidak berpasangan. Karena adanya urutan TΨC, ini dinamai sebagai “TΨC arm” di arah 5′-3 ‘. Lengan TΨC terdiri dari “Situs pengenalan ribosom” yang memainkan peran vital dalam pengikatan tRNA dengan ribosom.
Lengan variabel.
Ini adalah lengan tambahan yang hadir antara antikodon dan lengan TΨC. Lengan variabel adalah lengan terpendek yang kehadirannya berbeda antara spesies dengan spesies. Panjang lengan variabel mengenali enzim yang diterjemahkan untuk t-RNA. Lengan variabel membantu dalam stabilisasi t-RNA. Berdasarkan keberadaan lengan variabel, t-RNA dapat mengklasifikasikan menjadi dua jenis:
- Tipe-I t-RNA: Tipe t-RNA ini tidak memiliki lengan variabel.
- Tipe-II t-RNA: Tipe t-RNA ini terdiri dari kelompok variabel.
Struktur tersier tRNA.
Ini adalah struktur tiga dimensi yang sangat terlipat dan memiliki struktur berbentuk L.
Dalam struktur tersier t-RNA, akseptor dan lengan TΨC membentuk heliks yang diperpanjang ke bawah. Lengan antikodon dan DHU membentuk heliks yang diperpanjang ke atas. Karena perubahan dalam konfigurasi struktural, DHU dan TΨC bergabung di mana kedua heliks yang diperpanjang sejajar pada sudut 90 derajat. Stabilisasi struktur tersier adalah melalui pemasangan dan penumpukan dasar.
Peranan
tRNA pertama-tama mengenali kodon mRNA dengan bantuan lengan antikodon. Lengan antikodon t-RNA terdiri dari tiga antikodon yang kemudian saling mengikat dengan kodon m-RNA. Ikatan komplementer ini kemudian mengaktifkan sintesis enzim yang dikenal sebagai “Aminoacyl tRNA synthetase”. Enzim sintetase akan membantu pengikatan asam amino spesifik sesuai dengan kodon yang akan mengkode asam amino tertentu.
Enzim aminoacyl tRNA synthetase berbeda untuk setiap asam amino. Ketika kedua asam amino dan molekul t-RNA menempel dengan enzim sintetase, itu akan mempromosikan pengikatan baik t-RNA dan asam amino dengan bantuan molekul ATP.
Setelah enzim sintetase mengisi t-RNA, itu akan memuat asam amino dan mentransfernya ke ribosom di mana asam amino bergabung untuk membangun protein.
